تنوع ژنتیکی جدایه‌های فیتوپلاسمای همراه با بیماری جاروک بادام دراستان‌های فارس‌، کرمان و کردستان‌

بیماری جاروک بادام که فیتوپلاسمای همراه با آن Candidatus Phytoplasma phoenicium نام دارد در حال حاضر یکی از مخرب‌ترین بیماری‌های بادام در ایران و لبنان است. تنوع ژنتیکی در فیتوپلاسمای همراه با جاروک بادام در نمونه‌های تهیه شده در دو نقطه از باغ‌های اطراف نیریز (جدایه‌های نیریز1ونیریز2)، یک نقطه از مشکان نیریز(جدایه مشکان)، دو نقطه در اطراف کرمان (جدایه‌های کرمان1وکرمان2) ویک نقطه در شهرستان سنندج (جدایه سنندج) بررسی گردید. نهال‌های بادام تلخ مایه‌زنی شده با جدایه‌های عامل جاروک بادام در شرایط کنترل شده واکنش‌های متفاوتی را نشان دادند.RFLP محصول PCR مستقیم با جفت آغازگرP1/P7(تقریباً 1800 جفت باز از اپرون ار.ان.ای ریبوزومی) با آنزیم‌های, CfoI, HaeIII, HinfI, HpaII, RsaI, TaqI AluI نشان داد که جدایه مشکان از نظر نقوس حاصل از برش با انزیم CfoI و جدایه کرمان 2 از نظر نقوش حاصل از برش با آنزیمHinfIبا بقیه متفاوت‌اند و بر این اساس جدایه‌های مورد مطالعه در 3 گروه قرار می‌گیرند.جدایه مشکان در گروه یک، جدایه کرمان2 در گروه دو و جدایه‌های کرمان ا، سنندج، نی‌ریز 1 و نی ریز 2 در گروه سه قرار گرفتند. مقایسه میزان تشابه نوکلئوتیدی در ناحیه  SRنیز تفاوت جدایه‌های عامل جاروک بادام را تأیید کرد و نشان داد که جدایه مشکان با دیگر جدایه‌های مورد مطالعه تفاوت قابل ملاحظه‌ای دارد.بررسی تبارزایی براساس ترادف اپرون آر ان ای ریبوزومی، جدایه‌های عامل جاروک بادام را در گروه جاروک نخود کبوتر (16S rIX, Pigeon pea witches' broom)قرار داد و نشان داد که این جدایه‌ها یکسان نیستند. تمامی بررسی‌های مولکولی تفاوت جدایه خفر با جدایه‌های مورد مطالعه در این تحقیق را تأیید کرد. بررسی‌های RFLP، مقایسه میزان تشابه نوکلئوتیدی و تبارزایی نشان داد که تفاوت ژنتیکی جدایه‌های جاروک بادام مربوط به 600 جفت باز از اپرون ار ان ای ریبوزومی شامل انتهای́ 5ژن 16S، ناحیهSR  و ابتدای́  3ژن 23S است.